Назначение 
По предназначению мыши можно разделить на модели для работы с настольным компьютером (классические) и для ноутбуков (мобильные). Отличия заключаются в конструктивных особенностях, делающих использование мыши наиболее целесообразным в определенных условиях. Так, по сравнению с классическими моделями, мыши для ноутбуков имеют меньшие размеры и небольшой вес, что облегчает транспортировку. Обычно на мышах для ноутбуков отсутствуют дополнительные клавиши. Разделение мышей на классические и мобильные достаточно условно: классические мыши могут использоваться с ноутбуками, а "ноутбучные" - с настольными компьютерами.
Интерфейс 
Интерфейс подключения устройства.
Тип сенсора 
Принцип работы оптических мышей состоит в следующем: под мышью с помощью светодиода и системы линз подсвечивается участок поверхности. Свет, отраженный от поверхности, через другую линзу попадает на приемный сенсор микросхемы. Процессор обработки изображений фотографирует поверхность с высокой частотой и обрабатывает полученные снимки. Анализ ряда последовательных изображений позволяет процессору рассчитать направление перемещения и скорость движения курсора.
В лазерных мышах для подсветки поверхности используется лазер. Лазер, в отличие от светодиода, испускает узконаправленный пучок света, благодаря чему получаемые сенсором изображения более контрастны, а позиционирование курсора достигает высокой точности.
Разрешение оптического сенсора dpi

Разрешение приемного сенсора микросхемы оптической мыши.
Измеряется в dpi - числе точек на дюйм. Данный параметр показывает, сколько измерений перемещения происходит на каждом пройденном мышью дюйме. Чем больше измерений происходит на единице пути мыши, тем дальше продвинется курсор. Т.е. для передвижения курсора на N пикселей мышь с большим разрешением должна пройти меньшее физическое расстояние. Большее разрешение сенсора мыши позволяет точнее позиционировать курсор и увеличивает скорость его передвижения. Для комфортной работы в среде Windows, офисных приложениях и большинстве графических программ достаточно разрешения 800 dpi.
Дизайн мыши 
По дизайну мыши делятся на предназначенные для правой руки, предназначенные для левой руки, и мыши, с которыми можно работать как правой, так и левой рукой. Выбирайте дизайн в соответствии со своими предпочтениями (например, если вы левша, мыши для правой руки вам не подойдут).